分子篩結(jié)果解讀
尺寸排阻色譜(SEC)也稱為凝膠色譜,俗稱分子篩。當(dāng)洗脫液為水溶液或緩沖液時(shí),稱為凝膠過濾色譜(GFC),在生物學(xué)領(lǐng)域應(yīng)用廣泛;當(dāng)使用有機(jī)溶劑作為洗脫液時(shí),稱為凝膠滲透色譜(GPC),被廣泛用于高分子領(lǐng)域。尺寸排阻色譜通常用于分離高分子化合物,如組織提取物、多肽、蛋白質(zhì)和核酸。
尺寸排阻色譜基于蛋白質(zhì)分子量或分子形狀的差異對樣品進(jìn)行分離。當(dāng)樣品從色譜柱頂部向下移動時(shí),大的蛋白質(zhì)分子無法進(jìn)入凝膠顆粒并被快速洗脫;而較小的蛋白質(zhì)分子可以進(jìn)入凝膠顆粒,并且較小的蛋白質(zhì)進(jìn)入凝膠的保留時(shí)間不同。分子量越大,洗脫時(shí)間越早,從而使具有不同分子大小的蛋白質(zhì)被分離。
圖1.體積排阻色譜法原理(Wolf et al, 2015)
在蛋白分離純化中也常用到分子篩,主要有兩個(gè)作用,一是分離純化;二是蛋白分析,新手接觸的時(shí)候不知道怎么去分析分子篩結(jié)果,下面以不同的實(shí)例解讀一下些各自的區(qū)別。
分離純化作用
在科研實(shí)驗(yàn)中,蛋白純化第一步通常采用親和層析,但一步層析大部分情況下很難達(dá)到很高的純度,根據(jù)SDS-PAGE膠圖結(jié)果,可以選用分子篩來進(jìn)一步分離純化目的蛋白,需要注意的是分子篩規(guī)格的選擇,不同大小的蛋白選用的柱子規(guī)格可能有差異,需要結(jié)合分子篩柱的分辨率來選擇,不熟悉的話可以查詢柱子說明書。
圖2.鎳柱純化結(jié)果
(泳道8、9為Elution結(jié)果)
圖3.泳道8/9過分子篩圖譜
圖4. 分子篩電泳結(jié)果
從結(jié)果可看出分子篩能有效分離雜蛋白與目的蛋白。但要注意的是,使用分子篩分離純化目的蛋白的時(shí)候分子量之間應(yīng)該有較大差異(一倍以上分子量)才能有效分離。
蛋白分析作用
分子篩的另一個(gè)作用是作為蛋白分析工具,多聚集態(tài)蛋白與單體蛋白分子量不一樣,復(fù)合物與單個(gè)亞基分子量也不一樣,分子篩可以利用這種有差異的分子量來分析、分離蛋白狀態(tài)。
圖5.蛋白分析結(jié)果
(泳道1為親和層析樣品,純度高,分子篩有兩個(gè)峰,主峰明顯,
可能是二聚體或者是多聚體,樣品均一性較好)
圖6.蛋白分析結(jié)果
親和層析純化后蛋白樣品純度高,分子篩分析出現(xiàn)兩個(gè)明顯峰尖,sds-pag膠檢測蛋白大小一致,可以看出蛋白純化后均一性不高,多聚態(tài)和單體混合存在,通過分子可以分離出不同狀態(tài)蛋白,后續(xù)可根據(jù)需要選用不用狀態(tài)蛋白開展工作。